Para el gobierno el control de la pesca ilegal y el narcotráfico serían dos de los cometidos principales de una base naval en Fray Bentos.
En un documento que dio a conocer Búsqueda se supo que el proyecto que tiene el apoyo del ministro Javier García tiene algunos cambios respecto del original que había realizado el ex ministro de Defensa, Eleuterio Fernández Huidobro. Según un documento interno del ministerio la base pretende «contribuir a garantizar el corredor de aguas seguras para la navegación del río Uruguay y su balizamiento» y para «lograr el ejercicio de la soberanía a través de la presencia y el apoyo permanente que incluye el territorio insular».
La venta del predio en Carrasco donde funciona la Escuela Naval es una de las opciones para generar recursos propios que permitan realizar la base.
La propuesta de García no contaría con el apoyo de Cabildo Abierto, partido liderado por Guido Manini Ríos.